Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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LRRTM2O43300 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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LRRTM2O43300 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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LRRTM2O43300 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
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LRRTM2O43300 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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