Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF1O43189 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms