Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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CLDN25C9JDP6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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