Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms