Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
YJEFN3A6XGL0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms