Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms