Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms