Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms