Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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