Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLIP2Q9UDT6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms