Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NXF3Q9H4D5 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms