Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRCC1Q9C099 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms