Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms