Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms