Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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