Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SPOCK3Q9BQ16 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SPOCK3Q9BQ16 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 LINC02204-201ENST00000630447 3206 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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SPOCK3Q9BQ16 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SPOCK3Q9BQ16 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SPOCK3Q9BQ16 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPOCK3Q9BQ16 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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