Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AC078899.4-201ENST00000593952 1113 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AL138729.1-201ENST00000406666 664 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KCTD12Q96CX2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms