Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN4Q92575 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms