Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOPBP1Q92547 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms