Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms