Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SAPCD1Q5SSQ6 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SAPCD1Q5SSQ6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SAPCD1Q5SSQ6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SAPCD1Q5SSQ6 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SAPCD1Q5SSQ6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SAPCD1Q5SSQ6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms