Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A3Q5K4L6 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms