Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms