Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCAF6Q58WW2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms