Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1BQ53T94 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms