Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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