Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SS18Q15532 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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