Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM53BQ14153 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms