Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM29Q14134 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.3 ms