Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CBFBQ13951 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CBFBQ13951 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CBFBQ13951 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CBFBQ13951 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CBFBQ13951 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CBFBQ13951 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CBFBQ13951 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CBFBQ13951 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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CBFBQ13951 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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