Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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