Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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