Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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