Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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