Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CALCOCO2Q13137 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CALCOCO2Q13137 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CALCOCO2Q13137 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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