Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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GRIK3Q13003 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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GRIK3Q13003 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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