Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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