Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NPRL3Q12980 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms