Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms