Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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EFEMP1Q12805 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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EFEMP1Q12805 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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EFEMP1Q12805 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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EFEMP1Q12805 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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