Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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