Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms