Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms