Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms