Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms