Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX1P83916 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX1P83916 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX1P83916 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX1P83916 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX1P83916 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CBX1P83916 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBX1P83916 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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