Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NME5P56597 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NME5P56597 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NME5P56597 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NME5P56597 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NME5P56597 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms