Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GCLMP48507 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCLMP48507 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLMP48507 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms