Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETFBP38117 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETFBP38117 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETFBP38117 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETFBP38117 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETFBP38117 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms