Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms